代谢组学实验伯远生物代谢组学实验伯远生物是国家级专精特新小巨人企业农业农村部生物育种重点实验室牵头多项省部级重大专项公司科研技术人员500硕博占比40%以上是国内最大植物功能基因研究综合性平台15年技术沉淀每年完成功能基因研究数量50000长期服务课题组10000含清北、复旦、武大、华科等知名高校及所有农业类科研院所服务头部种业公司客户300余家涉及四十多个物种含水稻、玉米、小麦、马铃薯、大豆五大主粮以及禾本科高粱、甘蔗葫芦科黄瓜、西甜瓜茄科番茄、辣椒与十字花科等100多个品种的50多个性状含抗虫抗病、抗除草剂、品质提升、株型改良等各类仪器设备投资超1个亿高标准恒温繁育基地200亩案例展示案例展示期刊Plant Cell Environment影响因子7.3发表年份2021一、研究背景植物侧根的发育受内源激素信号和外部环境因素的协同调控。根际微生物作为重要的生物因子可以通过促进根细胞分裂和分化而显著影响根的发育。然而目前对根际微生物调控植物侧根发育的活性物质和调控机制尚不完全清楚。二、研究结果根际促生菌解淀粉芽孢杆菌SQR9产生的挥发性物质可诱导主根上的大量形成侧根起始点还可以增强侧根原基的生长素信号促进早期侧根原基起始和后期侧根原基的发育导致主根上形成更多的侧根SQR9对侧根形成的调控受到生长素信号通路、极性运输等的介导。图 解淀粉芽孢杆菌诱导拟南芥侧根发育的分子模型参考文献Yucong L, Jiahui S , Yuanming X, et al. Volatile compounds from beneficial rhizobacteria Bacillus spp. promote periodic lateral root development in Arabidopsis[J].Plant Cell Environment,2021,44:1663–1678.背景说明背景说明GC-MS挥发性代谢组学一种基于GC-MS技术对生物样本中的代谢物进行定性和定量分析的常用代谢组学研究方法。该方法具有敏度高、定性能力强稳定可靠等优点。GC-MSS挥发性代谢组检测的物质是挥发性及部分半挥发性物质如醇类、醛类、酮类、烃类、酯类等。通过对实验组和对照组样本中的这些代谢物进行分析找到差异代谢物为植物生长发育研究、植物逆境胁迫研究等研究提供方向。服务流程服务流程客户在线下单——样本信息及分析需求的确认——样本制备——GC-MS分析——代谢物定性定量分析——单变量/多元统计学分析——差异代谢物分析——功能富集及注释分析——结果交付图 非靶向代谢组学技术流程服务内容及说明服务内容及说明技术优势1、通量高一次性对样本中所有代谢物进行全面检测分析2、质控严格采用最严格的QC系统保证每个项目的定性定量结果3、数据质量高高标准的谱图匹配4、优质服务专业的售前售后及文章写作全面辅导适用场景1、植物的生长发育2、植物成色机理研究3、生物胁迫与非生物胁迫4、植物物质合成通路研究样品要求客户下单及项目信息填写在我司官网http://plant.biorun.com/进行注册或登录请客户按照页面提示填写项目名称、选择项目类型、填写个人信息及联系方式提交项目所需要的具体信息包括1、样品来源、含量、状态及其他基本信息2、生信分析的具体需求。实验信息实验过程中客户可以随时登入管理系统查看项目实时进展情况。实验结题时系统会通过短信自动通知客户并发送实验报告查看网址。实验结题后实验报告、检测结果可在线查看或打印。实验交付内容1、完整的结题报告2、生物信息学分析结果包括a、数据质控分析QC、RSDb、代谢物的差异分析单变量统计分析、PCA、OPLS-DA、差异代谢物热图、差异代谢物火山图、韦恩图、差异代谢物VIP图等c、功能注释分析层级聚类分析、KEGG注释分析、KEGG富集分析。代谢组学实验通常由研究设计、样本准备、仪器检测、数据处理与生物学解释四个部分组成核心目标是在控制混杂因素和批次效应的前提下可靠地捕捉样本中代谢物的差异变化。1.研究设计先明确科学问题疾病机制、标志物筛选、药物响应、环境应激或多组学整合。明确样本类型血清、血浆、尿液、组织、细胞、植物材料或微生物提取物等。代谢组学实验设计分组、重复数和时间点优先保证生物学重复和对照匹配。2.样本准备采样要标准化尽量避免溶血、反复冻融和长时间室温放置。